Le variant Omicron a été nommé d'après une lettre de l'alphabet grec, conformément aux directives de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) sur la dénomination des variants, afin d'éviter la stigmatisation associée aux appellations liées à l'origine géographique d'un variant (ex. : variant sud-africain).
On constate parfois une hésitation entre la minuscule et la majuscule dans le nom de la lettre grecque (variant omicron ou variant Omicron). Bien que l'on emploie généralement la minuscule dans les termes scientifiques formés sur un modèle semblable (hépatite delta, carbure epsilon, ondes gamma, etc.), l'emploi de la majuscule s'est généralisé dans l'usage pour les variants de la COVID-19.
